cfDNA идентифицира рака на гърдата по-добре от мамографията

Въз основа на модела на метилиране на безклетъчна ДНК, циркулираща в кръвта, едно проучване успява да открие по-надеждно рака на гърдата, отколкото мамографията. За това са необходими само четири маркера за метилиране.

Скринингът на базата на мамографията е настоящият стандарт за ранно откриване на рак на гърдата. Според литературата специфичността на метода е 92%, чувствителността 70%. Последното обаче зависи от плътността на тъканта: колкото е по-плътна, толкова по-трудно се открива.

Така че определено има нужда от по-надеждни методи за ранно откриване на рака на гърдата. Изследователи, ръководени от Xianyu Zhang от катедрата по гръдна хирургия в Университетската онкологична клиника в Харбин, Китай, съобщават за опит за използване на cfDNA. Включени са 204 жени с хистологично потвърдена диагноза рак на гърдата, в сравнителната група са включени129 здрави жени .

Използвайки компютъризиран анализ на профилите на метилиране, записани от The Cancer Genome Atlas, те идентифицират диапазон от 3 288 специфични маркера: CpG последователности, където метилирането се различава при ракова и здрава тъкан. След това те сравняват маркерите с моделите на метилиране в тъканните проби и cfDNA в кръвните проби на пациенти с рак. Крайният резултат – диагностичен предсказващ модел, съставен от 26 маркера, който бива използван за разграничаване на жени с рак на гърдата и здрави контроли, използващи cfDNA.

Висока честота на съвпадения

Ако се вземат числата като критерий, чувствителността при рака на гърдата достига 89%, специфичността е 100%. Площта под кривата на ROC, която се дефинира, когато процент на истински положителните  спрямо този на фалшиво положителните на различните прагови стойности за степента на метилиране, е  0,98. Стойностите на Precision-Recall-Кривата  (PRC) са подобни . В него положителната прогнозна стойност и фалшиво положителният процент, т.е. чувствителността, са свързани. В сравнение с кривата ROC, това трябва да предложи предимства за набори от данни, които са небалансирани по отношение на резултатите. Стойността на КНР достигна 0,97. ROC и PRC са над това, което може да се постигне мамографски при участниците в проучването (ROC: 0,93; PRC: 0,95).

След това Джан и колегите му опростяват изследването от 26 до набор от 4-ри маркера. Това не е променило  диагностичното значение на теста. Дори намаляването до единичен маркер за метилиране на cfDNA, cg23035715, се оказва диагностично ценно, с чувствителност от 85% и специфичност от 94% (ROC: 0.94, PRC: 0.91).

Малкият брой участници в проучванете би могъл да наруши достоверността на теста. Китайските учени обаче правят оптимистично заключение: „В обобщение, ние разработихме диагностичен модел, базиран на модела на метилиране на cfDNA, който се оказа надежден при ранната диагностика на рака на гърдата. Моделът с четири маркера обещава висок клиничен потенциал за ранна диагностика и скрининг за рак на гърдата. ” 

Източник: https://www.springermedizin.de